Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNRPD3P62318 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms