Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VBP1P61758 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VBP1P61758 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VBP1P61758 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VBP1P61758 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
VBP1P61758 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VBP1P61758 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms