Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK-16P61578 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERVK-16P61578 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms