Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2D3P61077 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2D3P61077 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2D3P61077 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D3P61077 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D3P61077 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2D3P61077 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms