Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
KRTAP12-1P59990 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms