Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KLF3P57682 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLF3P57682 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLF3P57682 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms