Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBASH3AP57075 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBASH3AP57075 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms