Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RWDD2BP57060 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RWDD2BP57060 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RWDD2BP57060 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms