Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BACE1P56817 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BACE1P56817 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BACE1P56817 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BACE1P56817 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BACE1P56817 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BACE1P56817 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BACE1P56817 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BACE1P56817 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BACE1P56817 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BACE1P56817 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms