Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OXCT1P55809 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OXCT1P55809 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OXCT1P55809 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms