Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MFAP3P55082 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MFAP3P55082 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MFAP3P55082 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms