Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMP1P54849 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMP1P54849 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMP1P54849 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMP1P54849 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EMP1P54849 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EMP1P54849 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms