Protein–RNA interactions for Protein: P54577

YARS, Tyrosine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YARSP54577 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YARSP54577 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YARSP54577 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YARSP54577 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YARSP54577 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YARSP54577 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
YARSP54577 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YARSP54577 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YARSP54577 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YARSP54577 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
YARSP54577 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YARSP54577 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YARSP54577 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YARSP54577 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms