Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNB3P54284 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNB3P54284 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms