Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACLYP53396 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACLYP53396 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACLYP53396 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACLYP53396 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACLYP53396 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACLYP53396 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACLYP53396 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACLYP53396 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACLYP53396 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACLYP53396 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms