Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF143P52747 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF143P52747 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms