Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GPC3P51654 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GPC3P51654 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GPC3P51654 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GPC3P51654 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GPC3P51654 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GPC3P51654 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms