Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PPT1P50897 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PPT1P50897 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PPT1P50897 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PPT1P50897 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PPT1P50897 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms