Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF6P49848 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TAF6P49848 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF6P49848 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF6P49848 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF6P49848 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms