Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GSK3BP49841 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms