Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RARRES1P49788 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RARRES1P49788 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms