Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FNTAP49354 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNTAP49354 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FNTAP49354 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNTAP49354 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTAP49354 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTAP49354 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTAP49354 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTAP49354 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FNTAP49354 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNTAP49354 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNTAP49354 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNTAP49354 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNTAP49354 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms