Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A3P48751 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A3P48751 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms