Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCLMP48507 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GCLMP48507 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GCLMP48507 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GCLMP48507 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GCLMP48507 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GCLMP48507 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GCLMP48507 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms