Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ALDH1A3P47895 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALDH1A3P47895 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms