Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
RANGAP1P46060 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RANGAP1P46060 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RANGAP1P46060 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms