Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MAGEA3P43357 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MAGEA3P43357 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms