Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSR1P43307 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSR1P43307 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSR1P43307 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SSR1P43307 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSR1P43307 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSR1P43307 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSR1P43307 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms