Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRATP43155 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRATP43155 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRATP43155 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRATP43155 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRATP43155 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CRATP43155 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRATP43155 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRATP43155 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRATP43155 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRATP43155 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRATP43155 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms