Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms