Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL35P42766 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL35P42766 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL35P42766 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL35P42766 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms