Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PIK3CBP42338 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms