Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBEC1P41238 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOBEC1P41238 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms