Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MLH1P40692 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MLH1P40692 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MLH1P40692 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MLH1P40692 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MLH1P40692 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms