Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
THPOP40225 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
THPOP40225 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
THPOP40225 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
THPOP40225 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THPOP40225 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THPOP40225 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
THPOP40225 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
THPOP40225 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
THPOP40225 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
THPOP40225 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms