Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TGFBR1P36897 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TGFBR1P36897 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms