Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPA3P35244 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPA3P35244 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPA3P35244 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPA3P35244 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA3P35244 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPA3P35244 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPA3P35244 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms