Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BMI1P35226 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BMI1P35226 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BMI1P35226 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BMI1P35226 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BMI1P35226 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
BMI1P35226 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BMI1P35226 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BMI1P35226 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BMI1P35226 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMI1P35226 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BMI1P35226 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms