Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASQ1P31415 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASQ1P31415 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms