Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXC8P31273 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXC8P31273 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms