Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXA9P31269 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXA9P31269 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms