Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CHRNA5P30532 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CHRNA5P30532 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms