Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CASP1P29466 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CASP1P29466 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CASP1P29466 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CASP1P29466 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CASP1P29466 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CASP1P29466 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms