Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GJB2P29033 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GJB2P29033 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GJB2P29033 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GJB2P29033 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GJB2P29033 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GJB2P29033 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
GJB2P29033 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GJB2P29033 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GJB2P29033 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms