Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CD34P28906 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CD34P28906 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD34P28906 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD34P28906 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD34P28906 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms