Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GABRB3P28472 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GABRB3P28472 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms