Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	RRP42	YDL111C	798 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	GRX2	YDR513W	432 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	MPC3	YGR243W	441 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YIL161W	YIL161W	708 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YNL320W	YNL320W	855 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	TFB6	YOR352W	1032 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PHO88	YBR106W	567 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	FAS1	YKL182W	6156 nt		3.62	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PLP1	YDR183W	693 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	LIF1	YGL090W	1266 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	TDA10	YGR205W	873 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	AGE2	YIL044C	897 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	ERG20	YJL167W	1059 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	ILV5	YLR355C	1188 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RAD33	YML011C	534 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	MTR4	YJL050W	3222 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SET1	YHR119W	3243 nt		3.61	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	TEC1	YBR083W	1461 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SPH1	YLR313C	1593 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RPN2	YIL075C	2838 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	ECM11	YDR446W	909 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YDR535C	YDR535C	501 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YEL075C	YEL075C	369 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	VFA1	YER128W	612 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SPT15	YER148W	723 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SOD1	YJR104C	465 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PML39	YML107C	1005 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RPL19B	YBL027W	570 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	PNO1	YOR145C	825 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YOR238W	YOR238W	912 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	KAP95	YLR347C	2586 nt		3.6	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	SMT3	YDR510W	306 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RPL1B	YGL135W	654 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	YHR097C	YHR097C	1101 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	IME1	YJR094C	1083 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	MRPS8	YMR158W	468 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	GIS2	YNL255C	462 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	RPL1A	YPL220W	654 nt		3.59	□□□□□ -1.83
RPC53	P25441	REC8	YPR007C	2043 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	CDC5	YMR001C	2118 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YGL177W	YGL177W	348 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	MMF1	YIL051C	438 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YKT6	YKL196C	603 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	COQ9	YLR201C	783 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	GOT1	YMR292W	417 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YOR073W-A	YOR073W-A	234 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	CCL1	YPR025C	1182 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	SUP45	YBR143C	1314 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YDR131C	YDR131C	1671 nt		3.58	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	HTA1	YDR225W	399 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	MPS2	YGL075C	1164 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	LSM12	YHR121W	564 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	ERG9	YHR190W	1335 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	TVP18	YMR071C	504 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	MTG1	YMR097C	1104 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	FYV6	YNL133C	522 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YNR066C	YNR066C	1311 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	ATG19	YOL082W	1248 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	IRC13	YOR235W	315 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YPR053C	YPR053C	456 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	ERV15	YBR210W	429 nt		3.57	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	FLO9	YAL063C	3969 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	HTD2	YHR067W	843 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YVH1	YIR026C	1095 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	MET14	YKL001C	609 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	HYM1	YKL189W	1200 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	GSP1	YLR293C	660 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	POL30	YBR088C	777 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YBR292C	YBR292C	372 nt		3.56	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	MTL1	YGR023W	1656 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	BI3	Q0115	1554 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	NDC80	YIL144W	2076 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	VPS9	YML097C	1356 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	CHA4	YLR098C	1947 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YDR193W	YDR193W	399 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	PUG1	YER185W	912 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YGL214W	YGL214W	486 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YGR039W	YGR039W	312 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	RGI2	YIL057C	495 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	VPS25	YJR102C	609 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YBL028C	YBL028C	321 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	SAM37	YMR060C	984 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	YNR062C	YNR062C	984 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	VAM3	YOR106W	852 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	NIP7	YPL211W	546 nt		3.55	□□□□□ -1.84
RPC53	P25441	SEA4	YBL104C	3117 nt		3.55	□□□□□ -1.84

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