Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA6P23229 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA6P23229 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms