Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB4P21439 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB4P21439 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB4P21439 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB4P21439 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB4P21439 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB4P21439 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB4P21439 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB4P21439 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms