Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ACO1P21399 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACO1P21399 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACO1P21399 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ACO1P21399 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACO1P21399 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACO1P21399 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACO1P21399 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACO1P21399 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACO1P21399 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACO1P21399 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACO1P21399 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACO1P21399 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms